"两组蛋白被划入MRD检测的发展潜力是具体的,期盼这些进展将继续提极高下一代MRD检测的效率。"
肝癌的MRD检测是一种灵敏且特异的主要用途检测肝癌患儿体液中的源性脱氧核糖核酸(如ctDNA)一般来说数量的作法。在这种状态下,患儿从未肉眼可见的肿瘤,但确实存有标准医学影像作法只能检测到但再次则会导致肝癌入院的扰小肿瘤。
MRD,常称为扰小存留肿瘤(Minimal Residual Disease)。采用“Minimal” (扰小)这个辞汇,是因为它在文献和医学领域专家中的不够特指。不过,“Minimal”这个辞汇或许带有“误导性”,因为低精准度的病变在生存率和疗程管理者方面也或许带有最重要意味。“Measurable”(可测量)一辞汇可不够精准地描述存留在病人体内的癌细胞的存有。NCCN指南同时采用了“Minimal Residual Disease”(扰小存留肿瘤)和“Measurable Residual Disease”(可测量存留肿瘤)两个概念。
此外,可行性研究课题表明在分子精准度上检测多种肝癌类型的ctDNA都只带有医学单单,文献和医学领域专家有时也则会采用“Molecular Residual Disease”(分子存留肿瘤)一辞汇。
近年来,国内在实质上中的基于ctDNA的MRD评量(ctDNA-MRD)的医学采样和证据越来越多,开启了实质上瘤MRD检测的风靡一时。实质上瘤ctDNA-MRD检测的技术流派主要有两大类:
1)Tumor-informed assays(知情研究)
对原发其两组织顺利进行人类基因组计划以鉴定患儿的特异遗传两组相异图谱,然后设计核酸定制panel或采用相同panel顺利进行个性化的ctDNA检测研究。
2)Tumor-uninformed assays(无计可施研究)
也可以称为Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays,即无必需原发其两组织,数依赖于一两组事前选定核酸/遮罩设计的与肝癌类型具体的相同panel顺利进行ctDNA检测研究,常在检测ctDNA遗传型的同时,;还有ctDNA两组蛋白或片段两组学等多两组学作法。弥补了其两组织采样不足或检测残基不足或TAT过长等问题。
Tumor-informed assays的技术策略不够符合大众的认知,在保证极高依赖性的以前提下,可通过检测多残基的sample-level(采样精准度)大大提极高其极高频率,技术门槛一般来说来说不是除此以外极高。Tumor-uninformed assays的技术策略不够典型早先用,通过提极高site-level(残基精准度)检测极高频率并;还有ctDNA两组蛋白或片段两组学并珠合数据处理算法大大提极高其极高频率和依赖性,技术门槛一般来说来说极极高。
2021年4年底29日,《Clinical Cancer Research》网络服务发表了“数采用白蛋白ctDNA检测珠癌患儿扰小存留肿瘤(MRD)”的文章,首次公开发表了Guardant Reveal的研究课题采样:MRD检测极高频率达到91%,依赖性达100%,这些见到背书了数白蛋白ctDNA-MRD检测(Tumor-uninformed assays)的潜在医学技术的发展。
2021年8年底13日,《Clinical Cancer Research》网络服务发表了“顺应潮流:数白蛋白ctDNA-MRD检测的技术的发展以前景”的文章,在这里研究课题者们讨论评量了数白蛋白ctDNA检测MRD的潜能,以及将两组蛋白建构到ctDNA检测的潜在好处。2
Parikh及其同僚1 和Taieb及其同僚3 讨论了数白蛋白ctDNA-MRD检测在珠癌(CRC)患儿中的的潜在医学技术的发展。
▲ ctDNA两组蛋白和遗传型在两项研究课题中的的技术的发展非常(Parikh和Taieb)
珠癌(CRC)的疗程仍然面临着一个挑战,即相当多的CRC患儿因早期疾病入院而提以前死亡。尽管医学采用了标准的常规疗程,但极高经常性IIIC期CRC患儿的5年生存率也数有53%,正因如此是从未见到影像学上未检测到的扰小存留肿瘤(MRD)。4
目以前,仍迫切并不必需要精准明确哪些患儿术后存有MRD,以帮助他的学生减少或上升常规疗程,并上升治愈的或许性,同时最大限度地减少不必要疗程的具体毒性。
在过去的几年里,我们对ctDNA在CRC诊断和生存率中的的技术的发展有了国际上的了解。目以前,基于ctDNA的MRD评量时是国际上技术的发展于肝癌的疗程中的。
ctDNA是由DNA的短片段两组成(分之一130-150bp),由癌细胞通过凋亡、坏死或分泌释放到循环系统中的。 ctDNA的半衰期较短所致其成为敏感的实时负荷;也,它的存有或许反映了影像学上看不见的扰重新分配。
在治愈性疗程珠束后,ctDNA中的出现的胚胎遗传型对随后的影像学入院带有极极高的特点性预期金融业价值,除此以外是当这些遗传型与外科手术的其两组织中的的遗传型相匹配时。检测这种ctDNA定义的MRD可以在I-III期CRC中的提以前影像学数年底预期入院,从而为一两组再次则会入院的CRC患儿给予一个评量新疗法的窗口。然而,这些ctDNA基础遗传型定义的MRD检测作法的极高频率仍然是极小的,迫切并不必需要改进其检测效率。
ctDNA的两组蛋白检测胜过ctDNA的基础遗传型检测。ctDNA的两组蛋白反常在CRC中的非常常见,并被认作大多数恶性肿瘤的早期阶段。这种两组蛋白,具体定义为DNA中的胞嘧啶的C5一段距离去除羟基基团,调节一处遗传的特别强调,最主要当代的愧依赖性失活。与基础遗传型相比,CRC中的存有不够多的两组蛋白反常区域内,为提极高MRD检测的极高频率给予了机则会。SEPT9,就是第一个利用体液检测单遗传两组蛋白反常顺利进行侵入性和早期检测CRC的作法。尽管ctDNA两组蛋白有这些实用性,但这些相同的特性也并不必需要谨慎,以保持良好检测研究的依赖性,并尽量减少真特点性的或许性。
在这种背景下,Parikh和Taieb的这两项年底所研究课题珠果为我们对ctDNA效率的解释给予了有用的补充,即无必需原发其两组织,数通过体液ctDNA两组蛋白或联合ctDNA遗传型即可顺利进行精准的MRD评量。与其他并不必需要对原发其两组织顺利进行人类基因组计划以他的学生后续ctDNA研究的检测相异,这两项研究课题探讨了Tumor-uninformed assays的确实,它有几个占优,最主要迅速的TAT,降低初始成本,对其两组织不足或不必需的患儿顺利进行检测。
Parikh等人给予了一种ctDNA两组蛋白珠合ctDNA基础遗传型的相同panel顺利进行MRD的研究评量(NGS作法),与其他金融业上必需的MRD检测作法相比,这种作法不并不必需要外科手术的其两组织以及定制化。在再次疗程后采用时,这种数白蛋白ctDNA-MRD检测对入院带有医学意味的依赖性(100%)和极高频率(55.6%),通过建构表征遗传两组特点和纵向检测研究,其极高频率可大大提极高至91%。1 该作法被主要用途时是在顺利进行的必要性研究课题,最主要他的学生IIA期尿毒症疗程管理者的NRG合作两组研究课题(NCT04068103)。虽然还并不必需要额外的采样集来验证这些见到,但这些珠果说明了基于ctDNA的MRD检测在无计可施的情况下可接受的检测效率特点。
Taieb等人的研究课题利用了一对先以前被证明是CRC外科手术后生存率具体的两组蛋白遗传上面物WIF1和NPY(ddPCR作法),并将它们技术的发展于PRODIGE-GERCOR IDEA-France试验,将III期CRC患儿随机分为3个年底 vs 6个年底的常规化疗。在对参加III期试验的III期CRC患儿顺利进行的首次ctDNA-MRD评量中的,有13.8%的患儿术后为ctDNA-MRD特点性,并被表明为独立的生存率;也。3 同时,研究课题者也指出,与其他采用NGS作法的ctDNA-MRD研究课题相比,本研究课题中的ctDNA的特点性率较低。极高频率和PPV都只大于NGS检测珠果,ctDNA-MRD特点性和复数的5年DFS分别为65%和73%,尽管常规疗程的和不理想的以前研究采样处理或许则会对这些珠果产生影响。该作法例外的是其一般来说有用,非常低的成本和潜在的重现性,不并不必需要金融业检测中的所见的注册商标检测作法。时是在顺利进行的必要性研究课题将进一步评量数白蛋白ctDNA检测是否并不需要精准评量MRD,以便对CRC患儿顺利进行经常性分层,并他的学生常规疗程管理者。
无论采用何种作法,数用白蛋白ctDNA-MRD检测来他的学生CRC患儿的疗程决定,并不必需要精确且精准的检测作法。必需大大提极高数白蛋白ctDNA-MRD检测的极高频率来明确哪些患儿可以从疗程垫底中的获益,以可避免不恰当地选择极高危患儿接受较低强度的疗程。Parikh及其同僚的研究课题珠果表明,建构遗传两组和表征遗传两组以及纵向白蛋白检测,可显著提极高数白蛋白ctDNA-MRD的极高频率。相比之下,ctDNA-MRD检测的极高依赖性对于ctDNA作为一个完整的人类;也来明确疗程升级是至关最重要的。由于依赖性不足,真特点性的ctDNA-MRD或许则会使患儿接受不必要的强化疗程。Parikh及其同僚的研究课题珠果证明,除基础遗传型外,还可以通过珠合表征遗传两组两组蛋白特点的研究来保持良好依赖性。Taieb等人的研究作法的占优在于提极高了医学特点的极高频率和生存率,但是,时是如研究课题者宣称的那样,单独的两个遗传两组蛋白上面或许只能给予与珠合基础遗传型作法的效率特点。最重要的是,这项临时工也特别强调了标准化研究以前必需的最益处,因为各种提取作法可以在很大程度上影响ctDNA的得率和完整性。在未来会的研究课题中的,这些研究以前的考虑将趋于越来越最重要。
两组蛋白被划入MRD检测的发展潜力是具体的,期盼这些进展将继续提极高下一代MRD检测的效率。总之,数白蛋白ctDNA-MRD的检测给予了一个与众不同的机则会,采用一种无创作法来探求疗程建议,并有或许根治极高危患儿的扰以前列腺癌肿瘤。这些研究课题珠果无疑为未来会ctDNA-MRD他的学生的必要性医学试验在此之后了道路。
MRD,仍然是一个迅速发展的领域,我们预计近两年或许则会出现新的证据,要么推测出MRD检测的医学单单的局限性,要么推测出MRD检测的其他占优和新功用。
简介:
1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.
2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.
3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.
4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.
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